2009-2013,云南大学,生物学基地班,学士
2013-2016,中国科学院昆明动物研究所,遗传学,硕士
2016-2018,中国科学院北京基因组研究所,研究实习员
2018-2023,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心),基因组学,博士
2023-2025,博士后,中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）
2025-至今,中国科学院广州生物医药与健康研究院,课题组长（副研究员）
在生命过程中，细胞身份的确立与转换受到多层级表观遗传信息的精确调控。从胚胎发育到成体干细胞分化，再到细胞重编程或转分化过程，细胞如何精确地协调DNA甲基化“记忆”、组蛋白修饰介导的染色质状态、RNA化学修饰介导的转录后微调等多种表观遗传信息，精准调控基因表达程序，从而决定细胞身份？而当免疫细胞、神经细胞或肿瘤细胞等遭遇氧化、饥饿、感染或药物处理等应激刺激时，又如何快速整合多组学层面的变化，实现适应性重编程？此类重编程又如何影响细胞的长期记忆（如免疫训练、耐受）或命运选择（如凋亡、衰老）？
为系统揭示细胞身份建立与命运抉择的核心机制，课题组建立了一系列高通量单细胞多组学共检测技术体系。该技术体系可在单次实验中对超过10万个细胞同时进行转录组与多维表观遗传信息的解析，涵盖基因表达、DNA甲基化、RNA动态修饰、染色质状态（组蛋白修饰/开放性）等多个层面。通过整合这些超高通量单细胞多组学数据，我们能够在单个细胞水平系统绘制基因调控的全景图谱，从而深入阐释细胞身份建立与维持、命运抉择、应激响应、疾病发生及机体衰老等复杂生命过程背后的调控机制。
围绕“表观遗传信息如何调控基因表达的时空特异性”这一核心科学问题，课题组将重点展开以下研究：
1) 单细胞跨模态组学（转录组+多维表观遗传组学）系统性解析细胞命运决定的调控机制
2) 空间标记与液滴微流控技术的空间单细胞多组学技术研发与跨尺度应用
3) 高通量单细胞多组学技术自动化系统研发
国家自然科学基金委员会, 青年科学基金项目, 单细胞空间多组学解析髓母细胞瘤神经递质受体作用及肿瘤微环境, 2025-01-01 至 2027-12-31, 30 万元, 主持
中国博士后科学基金会, 国家资助博士后研究人员计划, 单细胞空间多组学技术解析小鼠性别决定和性腺分化发育过程的分子机制, 2024-01 至 2025-12, 24 万元, 主持
1) Yun Li# , Zheng Huang# , Lubin Xu# , Yanling Fan# , Jun Ping# , Guochao Li, Yanjie Chen, Chengwei Yu, Qifei Wang, Turun Song, Tao Lin, Mengmeng Liu, Yangqing Xu, Na Ai, Xini Meng, Qin Qiao, Hongbin Ji, Zhen Qin, Shuo Jin, Nan Jiang, Minxian Wang, Shaokun Shu* , Feng Zhang* , Weiqi Zhang*, Guang-Hui Liu*, Limeng Chen*, Lan Jiang*. UDA-seq: universal droplet microfluidics-based combinatorial indexing for massive-scale multimodal single-cell sequencing, Nature Methods , 2025, 10.1038/s41592-024-02586-y. （IF发表当年: 32.1）
2) Yun Li# , Zheng Huang# , Zhaojun Zhang# , Qifei Wang, Fengxian Li, Shufang Wang, Xin Ji, Shaokun Shu, Xiangdong Fang, Lan Jiang*. FIPRESCI: droplet microfluidics based combinatorial indexing for massive-scale 5′-end single-cell RNA sequencing, Genome Biology , 2023, 24(1):70. (IF发表当年: 12.3)
3) Xiaoyue Gao# , Qiyuan Zhuang# , Yun Li # , Guochao Li # , Zheng Huang, Shenzhi Chen, Shaoxing Sun, Hui Yang*, Lan Jiang*, Ying Mao*. Single‐Cell Chromatin Accessibility Analysis Reveals Subgroup‐Specific TF‐NTR Regulatory Circuits in Medulloblastoma, Advanced Science , 2024, 11(30). （IF发表当年: 14.3）
4) Shan Jiang#, Zheng Huang#, Yun Li#, Chengwei Yu#, Hao Yu, Yuwen Ke, Lan Jiang*, Jiang Liu*. Single-cell chromatin accessibility and transcriptome atlas of mouse embryos, Cell Reports, 2023, 42(3): 112210.（IF发表当年: 8.8）
5) Xiaoqian Ji#, Zihao Chen#, Qiyuan Wang#, Bin Li, Yan Wei, Yun Li, Jianqing Lin, Weisheng Cheng, Yijie Guo, Shilin Wu, Longkun Mao, Yuzhou Xiang, Tian Lan, Shanshan Gu, Meng Wei, Joe Z. Zhang, Lan Jiang, Jia Wang, Jin Xu, Nan Cao*. Sphingolipid metabolism controls mammalian heart regeneration, Cell Metabolism , 2024, S1550-4131(24): 1-18
6) Xinxin Hang#, Shiqi He#, Zaizai Dong#, Yun Li, Zheng Huang, Yanruo Zhang, Hong Sun, Long Lin, Hu Li, Yang Wang, Bing Liu, Nan Wu, Tianling Ren, Yubo Fan, Jizhong Lou, Ruiguo Yang, Lan Jiang*, Lingqian Chang*. High‐Throughput DNA Tensioner Platform for Interrogating Mechanical Heterogeneity of Single Living Cells, Small, 2022, 18(12): 2106196
7) Hui Yang#, Songlin Yang#, Fei Fan, Yun Li, Shaoxing Dai, Xin Zhou, Cynthia C Steiner, Bretton Coppedge, Christian Roos, Xianghai Cai, David M Irwin, Peng Shi*. A New World Monkey Resembles Human in Bitter Taste Receptor Evolution and Function via a Single Parallel Amino Acid Substitution, Molecular Biology and Evolution , 2021, 38(12): 5472-5479
8) 蒋岚, 李芸, 黄正, 用于高通量标记细胞核酸分子的方法和试剂盒, 2023-9-18, 其他国家, PCT/CN2023/119479 (专利实质审查阶段)
9) 蒋岚, 李芸, 用于标记核酸分子的方法和试剂盒, 2020-12-31, 中国, ZL202111553752.7 (专利已授权)
