发布时间:2017-09-14来源:供稿:化学所 侯淑琳
分泌型磷脂酶A2(sPLA2s)与风湿性关节炎等炎症疾病和动脉粥样硬化等代谢性疾病密切相关,是开发治疗相应疾病的重要靶标。sPLA2s的药物开发已有近25年的历史,但目前为止尚无针对sPLA2s的药物上市,一个主要的原因是已开发的抑制剂选择性差。鉴于sPLA2s家族中不同成员在不同疾病中充当着互补或者相反的作用,有必要对不同sPLA2s亚型进行结构分析,揭示它们的结构特点和抑制剂结合口袋。研究sPLA2s和不同抑制剂复合物结构,将为开发具有亚型选择性抑制效果的抑制剂提供结构基础和方向指引。
近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院刘劲松课题组通过结构生物学和酶学方法,对人源sPLA2s成员Group IIE(hGIIE)的底物选择性和抑制剂结合机制进行了深入研究。该成果“Structural basis for functional selectivity and ligand recognition revealed by crystal structures of human secreted phospholipase A2 group IIE”于2017年9月7日在线发表于Scientific Reports上。广州生物院刘劲松课题组的博士生侯淑琳为该文的第一作者,陈凌课题组、许永课题组也参与了该课题研究。
在该研究中,研究人员通过对hGIIE在不同条件下的晶体结构进行比较分析,发现hGIIE的第二个钙结合位点比较灵活。研究人员通过进一步的突变体酶活性实验表明,hGIIE的第二个钙结合位点以及邻近的氨基酸Asn21对hGIIE的酶活性的发挥起着重要作用。
研究人员对hGIIE与抑制剂(LY311727、化合物8、14、24和Me-Indoxam)进行了复合物结构研究。与sPLA2s家族其他成员比较,研究人员发现hGIIE的底物结合口袋与其他sPLA2s有明显差别。进一步的突变实验以及抑制剂活性实验表明,氨基酸Asn21和Gly6是导致吲哚类抑制剂对hGIIE具有较好抑制效果的主要原因,对hGIIE进行抑制剂复合物结构研究将有助于基于结构的sPLA2s亚型选择性药物的设计。
该研究获得国家自然科学基金青年科学基金、广东省自然科学基金研究团队项目、广州市健康医疗协同创新重大专项、中科院干细胞和生物医药领域云等项目的经费支持。
hGIIE(灰色)与hGIIA(粉色)的结构比较
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